Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKRIP1Q9H875 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms