Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TAF1DQ9H5J8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1DQ9H5J8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms