Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCL3Q9H2J4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCL3Q9H2J4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms