Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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BCL11BQ9C0K0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
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BCL11BQ9C0K0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11BQ9C0K0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11BQ9C0K0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
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