Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL4Q9C0H6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL4Q9C0H6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms