Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms