Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
BBS2Q9BXC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BBS2Q9BXC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms