Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KATNB1Q9BVA0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms