Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RSG1Q9BU20 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RSG1Q9BU20 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms