Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NDC1Q9BTX1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms