Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTKNQ9BST9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms