Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP1Q9BPW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP1Q9BPW8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP1Q9BPW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms