Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SH3GL2Q99962 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SH3GL2Q99962 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms