Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGRRF1Q99675 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CGRRF1Q99675 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms