Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EYA3Q99504 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EYA3Q99504 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EYA3Q99504 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms