Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALS2CR12Q96Q35 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms