Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GBP4Q96PP9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GBP4Q96PP9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms