Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf49Q96NF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms