Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF396Q96N95 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF396Q96N95 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms