Protein–RNA interactions for Protein: Q96M98

PACRG, Parkin coregulated gene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACRGQ96M98 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PACRGQ96M98 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms