Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC42Q96M95 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC42Q96M95 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms