Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC7Q96M83 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms