Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC74BQ96LY2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC74BQ96LY2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms