Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD8Q96LT4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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SAMD8Q96LT4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SAMD8Q96LT4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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