Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C8orf48Q96LL4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms