Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM47Q96LD4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM47Q96LD4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM47Q96LD4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms