Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CAPZA3Q96KX2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CAPZA3Q96KX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms