Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RBM17Q96I25 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RBM17Q96I25 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms