Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP36Q96EU6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms