Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TVP23CQ96ET8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms