Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGF29Q96ES7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGF29Q96ES7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms