Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CMTM5Q96DZ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CMTM5Q96DZ9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms