Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM44Q96DX7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM44Q96DX7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms