Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UTP4Q969X6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UTP4Q969X6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms