Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF34Q969K3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF34Q969K3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms