Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRIPQ8WXE1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRIPQ8WXE1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms