Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATL2Q8NHH9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATL2Q8NHH9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms