Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ5

GPRC5A, Retinoic acid-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPRC5AQ8NFJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GPRC5AQ8NFJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GPRC5AQ8NFJ5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms