Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FSIP1Q8NA03 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FSIP1Q8NA03 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms