Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MSL3Q8N5Y2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms