Protein–RNA interactions for Protein: Q8N539

FIBCD1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIBCD1Q8N539 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FIBCD1Q8N539 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FIBCD1Q8N539 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms