Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NLGN4XQ8N0W4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms