Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC00518Q8N0U6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms