Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPUSD2Q8IZ73 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPUSD2Q8IZ73 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms