Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC117Q8IWD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC117Q8IWD4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms