Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CACNA2D4Q7Z3S7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms