Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SV2AQ7L0J3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SV2AQ7L0J3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms