Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCBE1Q6UXH8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCBE1Q6UXH8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms