Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX73

C16orf89, UPF0764 protein C16orf89, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf89Q6UX73 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C16orf89Q6UX73 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C16orf89Q6UX73 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms