Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LARP1Q6PKG0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LARP1Q6PKG0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms